できます。
数研アカウント（管理者用）のマイページにある「数研アカウント管理」に入り、「共有グループ管理」からおこなってください。
共有グループを1件ずつ個別に削除する方法と、複数まとめて一括で削除する方法があります。

個別に削除する

1. 「共有グループ管理」の画面で、削除したい共有グループの「詳細」をクリックします。
2.  画面下部の「共有グループを削除する」から削除します。

特定の共有グループの詳細を確認してから削除したい場合にお勧めです。

一括で削除する

1. 「共有グループ管理」の画面下部の「一括削除へ」をクリックします。
2.  削除したい共有グループにチェックをつけて削除します。

複数の共有グループをまとめて削除したい場合にお勧めです。

詳しくは、数研アカウント（管理者用）操作マニュアルの「共有グループを登録する、編集する」→「共有グループを削除する」をご覧ください。

なお、共有グループを削除した際の影響については、共有グループを削除するとどうなりますか。のページをご覧ください。