できます。

数研アカウント（管理者用）のマイページにある「数研アカウント管理」に入り、「共有グループ管理」から行ってください。

詳しくは、数研アカウント（管理者用）操作マニュアルの「共有グループを登録する、編集する」→「共有グループを削除する」をご覧ください。